گروه بندی و بررسی الگوی بیان ژن های خانواده bzip در ریشه گیاه گوجه فرنگی تحت تنش دمای پایین

Authors

پرویز حیدری

حمید نجفی زرینی

abstract

bzip      یکی از مهم­ترین عوامل رونویسی هستند که در اکثر تنش­ها فعال هستند و باعث بیان و تنظیم تعدادی زیادی ژن در طی تنش­های محیطی می­شوند. گیاه گوجه فرنگی دارای 73 ژن bzip است که تاکنون این ژن­ها گروه­بندی نشده­اند. در این تحقیق با استفاده از مطالعه نواحی فعالیت و اتصال به dna، این خانواده بزرگ از عوامل رونویسی گروه­بندی گردید. نتایج گروه­بندی نشان داد که bzips گوجه­فرنگی طبق عملکرد و میزان همولوژی با ژن­های bzip آرابیدوپسیس در یازده گروه قرار می­گیرند. سه ژن solyc06g074320، solyc01g109880 و solyc10g085210 به ترتیب از گروه­های d، i و b برای مطالعه بیان ژن تحت تنش دمای پایین انتخاب شدند. دو ژنوتیپ حساس به سرما (moneymaker) و مقاوم به سرما (la1777) گیاه گوجه فرنگی در مرحله گیاهچه­ای تحت شرایط دمای نرمال (23 درجه سانتی­گراد) و دمای پایین (15 درجه سانتی­گراد) برای مطالعه بیان ژن در ریشه کشت گردیدند.  نتایج نشان داد که ژن solyc06g074320  کمتر از solyc01g109880 و solyc10g085210 تحت تنش دمای پایین در ریشه گیاه گوجه­فرنگی القاء می­شود. نتایج این بررسی می­تواند نقطه شروعی برای  مطالعه عملکردی ژن­های خانواده bzip در آینده باشد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

گروه بندی و بررسی الگوی بیان ژن های خانواده bZIP در ریشه گیاه گوجه فرنگی تحت تنش دمای پایین

Transcription factors (TFs) are master regulators that control gene clusters Plant bZIP (basic region/leucine zipper) transcription factors play crucial roles in biological processes. The Tomato genome sequence contains 73 genes of bZIP transcription factors.  The bZIPs in tomato have never been classified. In this study, 73 genes of bZIP transcription factors were classified in 11 groups by th...

full text

تأثیر دمای پایین بر بیان ژن های درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه گیاهچه های گوجه فرنگی

اکسین به عنوان یک هورمون گیاهی دارای نقش چندگانه‌ای در تنظیم رشد و توسعه ساقه، ریشه و سایر اندام‌ها، تحت شرایط طبیعی و یا تنش است. در این تحقیق تغییرات رونوشت ژن‌های AUX/IAA، ARF، BRX و PIN4 درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه ی دو ژنوتیپ متحمل و حساس به سرما گیاه گوجه فرنگی تحت شرایط 15 درجه سانتی گراد مورد بررسی قرار گرفت. ژن AUX/IAA4 که تنظیم کننده منفی ژن‌های پاسخ به اکس...

full text

تأثیر دمای پایین بر بیان ژن های درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه گیاهچه های گوجه فرنگی

اکسین به عنوان یک هورمون گیاهی دارای نقش چندگانه‌ای در تنظیم رشد و توسعه ساقه، ریشه و سایر اندام‌ها، تحت شرایط طبیعی و یا تنش است. در این تحقیق تغییرات رونوشت ژن‌های AUX/IAA، ARF، BRX و PIN4 درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه ی دو ژنوتیپ متحمل و حساس به سرما گیاه گوجه فرنگی تحت شرایط 15 درجه سانتی گراد مورد بررسی قرار گرفت. ژن AUX/IAA4 که تنظیم کننده منفی ژن‌های پاسخ به اکس...

full text

تأثیر دمای پایین بر بیان ژن های درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه گیاهچه های گوجه فرنگی

اکسین به عنوان یک هورمون گیاهی دارای نقش چندگانه ای در تنظیم رشد و توسعه ساقه، ریشه و سایر اندام ها، تحت شرایط طبیعی و یا تنش است. در این تحقیق تغییرات رونوشت ژن های aux/iaa، arf، brx و pin4 درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه ی دو ژنوتیپ متحمل و حساس به سرما گیاه گوجه فرنگی تحت شرایط 15 درجه سانتی گراد مورد بررسی قرار گرفت. ژن aux/iaa4 که تنظیم کننده منفی ژن های پاسخ به اکسی...

full text

بررسی نواحی تنظیمی در پروموتور ژن‌های هم بیان تحت شرایط تنش دمای پایین در گوجه‌فرنگی

روش‌های نسل نوین توالی‌یابی همچون RNA-Seq توانایی ارائه حجم بالایی از اطلاعات در زمینه رونوشت ژن‌ها را دارند. بازسازی شبکه ژن‌های هم‌بیان بر اساس اطلاعات حاصل از داده‌های RNA-seq اطلاعات ارزشمندی جهت درک سیستم پاسخی گیاهان به تغییرات محیطی را ارائه می‌دهد. لذا در این تحقیق پروفایل کامل بیانی ژن‌های گوجه فرنگی تحت تیمار دمای پایین با استفاده از روش شبکه‌های هم بیان وزن‌دار مورد آنالیز قرار گرفت....

full text

بررسی نواحی تنظیمی در پروموتور ژن‌های هم بیان تحت شرایط تنش دمای پایین در گوجه‌فرنگی

روش‌های نسل نوین توالی‌یابی همچون RNA-Seq توانایی ارائه حجم بالایی از اطلاعات در زمینه رونوشت ژن‌ها را دارند. بازسازی شبکه ژن‌های هم‌بیان بر اساس اطلاعات حاصل از داده‌های RNA-seq اطلاعات ارزشمندی جهت درک سیستم پاسخی گیاهان به تغییرات محیطی را ارائه می‌دهد. لذا در این تحقیق پروفایل کامل بیانی ژن‌های گوجه فرنگی تحت تیمار دمای پایین با استفاده از روش شبکه‌های هم بیان وزن‌دار مورد آنالیز قرار گرفت....

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی

جلد ۸، شماره ۱۷، صفحات ۲۳-۱۷

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023